Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMCO1Q147U7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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