Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBM39Q14498 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBM39Q14498 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBM39Q14498 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBM39Q14498 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBM39Q14498 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBM39Q14498 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBM39Q14498 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBM39Q14498 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBM39Q14498 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBM39Q14498 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBM39Q14498 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBM39Q14498 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBM39Q14498 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBM39Q14498 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBM39Q14498 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBM39Q14498 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBM39Q14498 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBM39Q14498 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBM39Q14498 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBM39Q14498 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RBM39Q14498 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBM39Q14498 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBM39Q14498 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RBM39Q14498 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBM39Q14498 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBM39Q14498 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBM39Q14498 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBM39Q14498 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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RBM39Q14498 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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RBM39Q14498 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RBM39Q14498 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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