Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM53BQ14153 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM53BQ14153 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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