Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CDK13Q14004 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CDK13Q14004 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CDK13Q14004 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CDK13Q14004 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CDK13Q14004 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CDK13Q14004 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CDK13Q14004 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CDK13Q14004 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CDK13Q14004 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CDK13Q14004 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CDK13Q14004 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CDK13Q14004 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CDK13Q14004 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CDK13Q14004 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CDK13Q14004 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CDK13Q14004 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CDK13Q14004 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CDK13Q14004 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CDK13Q14004 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CDK13Q14004 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CDK13Q14004 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CDK13Q14004 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CDK13Q14004 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
CDK13Q14004 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CDK13Q14004 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CDK13Q14004 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CDK13Q14004 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CDK13Q14004 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CDK13Q14004 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CDK13Q14004 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
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