Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNASE1L3Q13609 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNASE1L3Q13609 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNASE1L3Q13609 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNASE1L3Q13609 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNASE1L3Q13609 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DNASE1L3Q13609 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNASE1L3Q13609 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNASE1L3Q13609 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNASE1L3Q13609 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNASE1L3Q13609 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNASE1L3Q13609 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNASE1L3Q13609 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DNASE1L3Q13609 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNASE1L3Q13609 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DNASE1L3Q13609 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNASE1L3Q13609 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DNASE1L3Q13609 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DNASE1L3Q13609 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms