Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX6Q13608 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX6Q13608 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX6Q13608 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
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