Protein–RNA interactions for Protein: Q13507

TRPC3, Short transient receptor potential channel 3, humanhuman

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC3Q13507 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPC3Q13507 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPC3Q13507 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPC3Q13507 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPC3Q13507 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPC3Q13507 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPC3Q13507 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPC3Q13507 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRPC3Q13507 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRPC3Q13507 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
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