Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LSAMPQ13449 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LSAMPQ13449 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSAMPQ13449 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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