Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MSLNQ13421 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSLNQ13421 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSLNQ13421 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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