Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PDE3BQ13370 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PDE3BQ13370 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
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