Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1H3Q13133 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR1H3Q13133 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1H3Q13133 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
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