Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FOXD4Q12950 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXD4Q12950 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXD4Q12950 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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