Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF2Q12933 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms