Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COX10Q12887 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COX10Q12887 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COX10Q12887 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COX10Q12887 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COX10Q12887 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
COX10Q12887 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COX10Q12887 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COX10Q12887 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COX10Q12887 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COX10Q12887 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COX10Q12887 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COX10Q12887 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COX10Q12887 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COX10Q12887 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COX10Q12887 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COX10Q12887 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COX10Q12887 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COX10Q12887 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COX10Q12887 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COX10Q12887 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COX10Q12887 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COX10Q12887 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COX10Q12887 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COX10Q12887 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COX10Q12887 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
COX10Q12887 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COX10Q12887 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COX10Q12887 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COX10Q12887 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COX10Q12887 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COX10Q12887 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COX10Q12887 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COX10Q12887 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
COX10Q12887 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COX10Q12887 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COX10Q12887 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
COX10Q12887 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COX10Q12887 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COX10Q12887 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COX10Q12887 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COX10Q12887 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COX10Q12887 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COX10Q12887 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COX10Q12887 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COX10Q12887 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COX10Q12887 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COX10Q12887 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COX10Q12887 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COX10Q12887 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COX10Q12887 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COX10Q12887 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COX10Q12887 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COX10Q12887 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
COX10Q12887 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
COX10Q12887 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COX10Q12887 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COX10Q12887 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COX10Q12887 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COX10Q12887 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COX10Q12887 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COX10Q12887 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COX10Q12887 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COX10Q12887 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COX10Q12887 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COX10Q12887 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COX10Q12887 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COX10Q12887 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
COX10Q12887 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COX10Q12887 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COX10Q12887 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COX10Q12887 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COX10Q12887 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COX10Q12887 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COX10Q12887 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
COX10Q12887 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COX10Q12887 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COX10Q12887 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COX10Q12887 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COX10Q12887 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COX10Q12887 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COX10Q12887 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COX10Q12887 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COX10Q12887 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COX10Q12887 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COX10Q12887 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COX10Q12887 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COX10Q12887 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COX10Q12887 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COX10Q12887 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COX10Q12887 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COX10Q12887 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COX10Q12887 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COX10Q12887 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COX10Q12887 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
COX10Q12887 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COX10Q12887 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COX10Q12887 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COX10Q12887 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
COX10Q12887 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms