Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGL1

LAMTOR4, Ragulator complex protein LAMTOR4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR4Q0VGL1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMTOR4Q0VGL1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMTOR4Q0VGL1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMTOR4Q0VGL1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMTOR4Q0VGL1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMTOR4Q0VGL1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMTOR4Q0VGL1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMTOR4Q0VGL1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMTOR4Q0VGL1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMTOR4Q0VGL1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMTOR4Q0VGL1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms