Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
LMOD3Q0VAK6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMOD3Q0VAK6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms