Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC15Q0P6D6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC15Q0P6D6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC15Q0P6D6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms