Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C2orf54Q08AI8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms