Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EGR3Q06889 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EGR3Q06889 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms