Protein–RNA interactions for Protein: Q03403

TFF2, Trefoil factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF2Q03403 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFF2Q03403 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFF2Q03403 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms