Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TGFBR3Q03167 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms