Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC25A11Q02978 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC25A11Q02978 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC25A11Q02978 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC25A11Q02978 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC25A11Q02978 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC25A11Q02978 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC25A11Q02978 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC25A11Q02978 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC25A11Q02978 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC25A11Q02978 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC25A11Q02978 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC25A11Q02978 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC25A11Q02978 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC25A11Q02978 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC25A11Q02978 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC25A11Q02978 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC25A11Q02978 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms