Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPIBQ01892 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPIBQ01892 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPIBQ01892 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms