Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC42EP1Q00587 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms