Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC5Q00444 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms