Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HTRA4P83105 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms