Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEP78395 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRAMEP78395 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms