Protein–RNA interactions for Protein: P63279

UBE2I, SUMO-conjugating enzyme UBC9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2IP63279 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE2IP63279 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2IP63279 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms