Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTG2P63267 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTG2P63267 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTG2P63267 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTG2P63267 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTG2P63267 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTG2P63267 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTG2P63267 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTG2P63267 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTG2P63267 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTG2P63267 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTG2P63267 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTG2P63267 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTG2P63267 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTG2P63267 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTG2P63267 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTG2P63267 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTG2P63267 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTG2P63267 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTG2P63267 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTG2P63267 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTG2P63267 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTG2P63267 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTG2P63267 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTG2P63267 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTG2P63267 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTG2P63267 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTG2P63267 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTG2P63267 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTG2P63267 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTG2P63267 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTG2P63267 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTG2P63267 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTG2P63267 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTG2P63267 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTG2P63267 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTG2P63267 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms