Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRA2BP62995 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRA2BP62995 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms