Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P62891 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P62891 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P62891 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P62891 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P62891 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P62891 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P62891 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P62891 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P62891 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P62891 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P62891 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P62891 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P62891 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P62891 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P62891 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P62891 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P62891 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P62891 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P62891 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P62891 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P62891 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P62891 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P62891 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P62891 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P62891 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL39P62891 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P62891 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P62891 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P62891 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P62891 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P62891 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P62891 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P62891 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P62891 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P62891 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P62891 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P62891 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P62891 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P62891 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P62891 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL39P62891 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P62891 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P62891 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P62891 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P62891 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P62891 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P62891 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P62891 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P62891 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P62891 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P62891 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P62891 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P62891 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P62891 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P62891 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P62891 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P62891 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P62891 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P62891 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P62891 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P62891 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P62891 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P62891 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P62891 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P62891 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P62891 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P62891 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P62891 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P62891 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL39P62891 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL39P62891 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL39P62891 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL39P62891 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P62891 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P62891 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P62891 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P62891 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P62891 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P62891 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P62891 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P62891 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P62891 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P62891 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P62891 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P62891 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P62891 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P62891 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P62891 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P62891 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P62891 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P62891 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P62891 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P62891 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P62891 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P62891 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P62891 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P62891 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P62891 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P62891 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms