Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBX1P62877 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBX1P62877 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBX1P62877 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBX1P62877 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBX1P62877 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBX1P62877 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBX1P62877 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBX1P62877 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBX1P62877 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBX1P62877 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBX1P62877 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBX1P62877 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBX1P62877 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBX1P62877 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBX1P62877 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBX1P62877 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBX1P62877 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBX1P62877 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RBX1P62877 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RBX1P62877 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBX1P62877 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBX1P62877 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBX1P62877 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBX1P62877 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RBX1P62877 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBX1P62877 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBX1P62877 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBX1P62877 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBX1P62877 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBX1P62877 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBX1P62877 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBX1P62877 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBX1P62877 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBX1P62877 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBX1P62877 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBX1P62877 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBX1P62877 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RBX1P62877 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBX1P62877 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBX1P62877 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RBX1P62877 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBX1P62877 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBX1P62877 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBX1P62877 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBX1P62877 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBX1P62877 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBX1P62877 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBX1P62877 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RBX1P62877 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBX1P62877 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RBX1P62877 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBX1P62877 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBX1P62877 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBX1P62877 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBX1P62877 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RBX1P62877 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBX1P62877 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBX1P62877 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBX1P62877 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBX1P62877 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBX1P62877 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBX1P62877 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBX1P62877 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBX1P62877 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBX1P62877 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBX1P62877 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBX1P62877 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBX1P62877 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBX1P62877 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBX1P62877 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBX1P62877 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBX1P62877 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBX1P62877 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBX1P62877 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBX1P62877 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBX1P62877 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBX1P62877 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBX1P62877 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBX1P62877 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBX1P62877 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBX1P62877 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBX1P62877 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBX1P62877 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBX1P62877 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBX1P62877 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBX1P62877 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RBX1P62877 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBX1P62877 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBX1P62877 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBX1P62877 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBX1P62877 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBX1P62877 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBX1P62877 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBX1P62877 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBX1P62877 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBX1P62877 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RBX1P62877 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBX1P62877 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBX1P62877 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms