Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTA2P62736 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTA2P62736 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms