Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11AP62491 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB11AP62491 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms