Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPD1P62314 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNRPD1P62314 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms