Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP46P62068 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
USP46P62068 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP46P62068 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP46P62068 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP46P62068 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP46P62068 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP46P62068 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP46P62068 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP46P62068 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP46P62068 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP46P62068 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP46P62068 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP46P62068 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP46P62068 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP46P62068 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP46P62068 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP46P62068 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP46P62068 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP46P62068 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP46P62068 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP46P62068 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP46P62068 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP46P62068 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP46P62068 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP46P62068 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP46P62068 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP46P62068 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP46P62068 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP46P62068 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP46P62068 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP46P62068 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP46P62068 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP46P62068 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USP46P62068 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP46P62068 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP46P62068 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP46P62068 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP46P62068 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP46P62068 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP46P62068 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP46P62068 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP46P62068 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP46P62068 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP46P62068 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP46P62068 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP46P62068 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP46P62068 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP46P62068 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP46P62068 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP46P62068 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP46P62068 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP46P62068 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP46P62068 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP46P62068 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP46P62068 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP46P62068 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP46P62068 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP46P62068 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP46P62068 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP46P62068 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP46P62068 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP46P62068 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP46P62068 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP46P62068 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP46P62068 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP46P62068 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP46P62068 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP46P62068 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP46P62068 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP46P62068 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP46P62068 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP46P62068 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP46P62068 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP46P62068 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP46P62068 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP46P62068 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP46P62068 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP46P62068 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP46P62068 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP46P62068 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP46P62068 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP46P62068 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP46P62068 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP46P62068 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP46P62068 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP46P62068 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP46P62068 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP46P62068 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP46P62068 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP46P62068 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP46P62068 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP46P62068 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP46P62068 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP46P62068 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP46P62068 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP46P62068 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP46P62068 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP46P62068 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP46P62068 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms