Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2FP61218 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms