Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME5P56597 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME5P56597 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME5P56597 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME5P56597 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME5P56597 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME5P56597 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME5P56597 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME5P56597 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME5P56597 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME5P56597 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME5P56597 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME5P56597 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME5P56597 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME5P56597 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME5P56597 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NME5P56597 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME5P56597 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME5P56597 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME5P56597 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME5P56597 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME5P56597 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NME5P56597 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME5P56597 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME5P56597 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME5P56597 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME5P56597 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME5P56597 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME5P56597 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME5P56597 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME5P56597 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME5P56597 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NME5P56597 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME5P56597 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NME5P56597 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME5P56597 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME5P56597 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME5P56597 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NME5P56597 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME5P56597 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME5P56597 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME5P56597 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME5P56597 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME5P56597 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME5P56597 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME5P56597 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME5P56597 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME5P56597 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME5P56597 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NME5P56597 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME5P56597 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME5P56597 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME5P56597 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME5P56597 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME5P56597 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME5P56597 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME5P56597 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME5P56597 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME5P56597 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME5P56597 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME5P56597 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME5P56597 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME5P56597 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME5P56597 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME5P56597 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME5P56597 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NME5P56597 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME5P56597 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME5P56597 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME5P56597 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME5P56597 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME5P56597 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME5P56597 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME5P56597 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME5P56597 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME5P56597 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME5P56597 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME5P56597 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME5P56597 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME5P56597 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME5P56597 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME5P56597 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NME5P56597 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NME5P56597 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NME5P56597 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NME5P56597 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NME5P56597 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME5P56597 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME5P56597 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME5P56597 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME5P56597 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME5P56597 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME5P56597 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NME5P56597 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME5P56597 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME5P56597 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME5P56597 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME5P56597 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME5P56597 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NME5P56597 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms