Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FOSBP53539 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOSBP53539 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOSBP53539 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOSBP53539 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOSBP53539 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOSBP53539 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOSBP53539 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOSBP53539 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOSBP53539 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOSBP53539 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOSBP53539 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FOSBP53539 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FOSBP53539 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
FOSBP53539 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FOSBP53539 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FOSBP53539 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FOSBP53539 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOSBP53539 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOSBP53539 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOSBP53539 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOSBP53539 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOSBP53539 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOSBP53539 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOSBP53539 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOSBP53539 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOSBP53539 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOSBP53539 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOSBP53539 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOSBP53539 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOSBP53539 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOSBP53539 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOSBP53539 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOSBP53539 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FOSBP53539 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOSBP53539 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOSBP53539 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOSBP53539 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOSBP53539 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOSBP53539 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOSBP53539 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOSBP53539 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOSBP53539 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOSBP53539 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOSBP53539 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
FOSBP53539 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOSBP53539 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOSBP53539 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FOSBP53539 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOSBP53539 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOSBP53539 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOSBP53539 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOSBP53539 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FOSBP53539 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOSBP53539 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOSBP53539 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOSBP53539 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOSBP53539 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
FOSBP53539 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOSBP53539 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOSBP53539 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOSBP53539 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FOSBP53539 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOSBP53539 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOSBP53539 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOSBP53539 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOSBP53539 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FOSBP53539 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOSBP53539 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FOSBP53539 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOSBP53539 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOSBP53539 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOSBP53539 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOSBP53539 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOSBP53539 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOSBP53539 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOSBP53539 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOSBP53539 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOSBP53539 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOSBP53539 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOSBP53539 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOSBP53539 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOSBP53539 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOSBP53539 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOSBP53539 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOSBP53539 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOSBP53539 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOSBP53539 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOSBP53539 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOSBP53539 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOSBP53539 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOSBP53539 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOSBP53539 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOSBP53539 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOSBP53539 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOSBP53539 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOSBP53539 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOSBP53539 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOSBP53539 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOSBP53539 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms