Protein–RNA interactions for Protein: P52849

NDST2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST2P52849 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDST2P52849 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDST2P52849 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST2P52849 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST2P52849 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST2P52849 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST2P52849 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST2P52849 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST2P52849 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST2P52849 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST2P52849 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST2P52849 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST2P52849 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST2P52849 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST2P52849 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST2P52849 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST2P52849 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDST2P52849 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST2P52849 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST2P52849 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST2P52849 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST2P52849 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST2P52849 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST2P52849 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST2P52849 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST2P52849 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST2P52849 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDST2P52849 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDST2P52849 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDST2P52849 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDST2P52849 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDST2P52849 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDST2P52849 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDST2P52849 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDST2P52849 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDST2P52849 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDST2P52849 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDST2P52849 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDST2P52849 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDST2P52849 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDST2P52849 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NDST2P52849 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDST2P52849 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDST2P52849 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDST2P52849 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDST2P52849 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDST2P52849 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDST2P52849 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDST2P52849 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDST2P52849 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDST2P52849 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDST2P52849 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NDST2P52849 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NDST2P52849 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDST2P52849 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NDST2P52849 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NDST2P52849 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDST2P52849 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDST2P52849 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDST2P52849 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDST2P52849 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDST2P52849 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDST2P52849 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDST2P52849 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDST2P52849 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDST2P52849 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDST2P52849 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST2P52849 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST2P52849 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST2P52849 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST2P52849 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST2P52849 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST2P52849 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST2P52849 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST2P52849 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST2P52849 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST2P52849 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST2P52849 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST2P52849 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST2P52849 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST2P52849 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST2P52849 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST2P52849 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST2P52849 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST2P52849 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST2P52849 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST2P52849 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST2P52849 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST2P52849 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST2P52849 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST2P52849 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST2P52849 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST2P52849 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDST2P52849 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDST2P52849 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDST2P52849 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDST2P52849 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDST2P52849 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDST2P52849 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDST2P52849 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms