Protein–RNA interactions for Protein: P51812

RPS6KA3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3P51812 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KA3P51812 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KA3P51812 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KA3P51812 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KA3P51812 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KA3P51812 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KA3P51812 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KA3P51812 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KA3P51812 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KA3P51812 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KA3P51812 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KA3P51812 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KA3P51812 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KA3P51812 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KA3P51812 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KA3P51812 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KA3P51812 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KA3P51812 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KA3P51812 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KA3P51812 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KA3P51812 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KA3P51812 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KA3P51812 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KA3P51812 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RPS6KA3P51812 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS6KA3P51812 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS6KA3P51812 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS6KA3P51812 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS6KA3P51812 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS6KA3P51812 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS6KA3P51812 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS6KA3P51812 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS6KA3P51812 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS6KA3P51812 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS6KA3P51812 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KA3P51812 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KA3P51812 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KA3P51812 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KA3P51812 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KA3P51812 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KA3P51812 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KA3P51812 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KA3P51812 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms