Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP1A2P50993 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP1A2P50993 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms