Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ETV1P50549 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETV1P50549 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETV1P50549 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETV1P50549 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETV1P50549 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETV1P50549 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETV1P50549 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETV1P50549 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETV1P50549 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETV1P50549 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETV1P50549 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETV1P50549 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETV1P50549 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETV1P50549 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ETV1P50549 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETV1P50549 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETV1P50549 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ETV1P50549 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ETV1P50549 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ETV1P50549 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ETV1P50549 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ETV1P50549 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ETV1P50549 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ETV1P50549 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ETV1P50549 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ETV1P50549 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ETV1P50549 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ETV1P50549 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ETV1P50549 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ETV1P50549 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ETV1P50549 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ETV1P50549 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ETV1P50549 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ETV1P50549 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ETV1P50549 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ETV1P50549 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ETV1P50549 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ETV1P50549 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ETV1P50549 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ETV1P50549 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ETV1P50549 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ETV1P50549 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ETV1P50549 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ETV1P50549 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ETV1P50549 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ETV1P50549 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ETV1P50549 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ETV1P50549 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ETV1P50549 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ETV1P50549 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ETV1P50549 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ETV1P50549 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ETV1P50549 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ETV1P50549 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ETV1P50549 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ETV1P50549 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ETV1P50549 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ETV1P50549 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ETV1P50549 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ETV1P50549 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ETV1P50549 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ETV1P50549 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ETV1P50549 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ETV1P50549 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ETV1P50549 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ETV1P50549 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ETV1P50549 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ETV1P50549 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ETV1P50549 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ETV1P50549 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ETV1P50549 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ETV1P50549 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ETV1P50549 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ETV1P50549 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ETV1P50549 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ETV1P50549 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ETV1P50549 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ETV1P50549 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ETV1P50549 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ETV1P50549 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ETV1P50549 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ETV1P50549 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ETV1P50549 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ETV1P50549 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ETV1P50549 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ETV1P50549 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ETV1P50549 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ETV1P50549 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ETV1P50549 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ETV1P50549 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ETV1P50549 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ETV1P50549 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ETV1P50549 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ETV1P50549 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ETV1P50549 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ETV1P50549 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ETV1P50549 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ETV1P50549 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ETV1P50549 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms