Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERFP50548 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERFP50548 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERFP50548 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERFP50548 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERFP50548 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERFP50548 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERFP50548 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERFP50548 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERFP50548 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ERFP50548 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERFP50548 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERFP50548 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERFP50548 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ERFP50548 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERFP50548 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERFP50548 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERFP50548 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERFP50548 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERFP50548 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERFP50548 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ERFP50548 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ERFP50548 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERFP50548 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERFP50548 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERFP50548 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERFP50548 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERFP50548 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERFP50548 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERFP50548 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERFP50548 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERFP50548 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERFP50548 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERFP50548 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERFP50548 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERFP50548 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERFP50548 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERFP50548 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERFP50548 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERFP50548 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERFP50548 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERFP50548 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERFP50548 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERFP50548 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ERFP50548 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERFP50548 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERFP50548 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERFP50548 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERFP50548 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERFP50548 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERFP50548 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERFP50548 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERFP50548 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERFP50548 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERFP50548 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERFP50548 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERFP50548 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERFP50548 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERFP50548 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERFP50548 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERFP50548 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERFP50548 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERFP50548 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERFP50548 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERFP50548 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERFP50548 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERFP50548 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERFP50548 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERFP50548 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERFP50548 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERFP50548 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERFP50548 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERFP50548 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERFP50548 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERFP50548 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERFP50548 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERFP50548 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERFP50548 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERFP50548 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERFP50548 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERFP50548 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERFP50548 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERFP50548 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERFP50548 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERFP50548 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERFP50548 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERFP50548 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERFP50548 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERFP50548 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERFP50548 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERFP50548 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERFP50548 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERFP50548 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERFP50548 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERFP50548 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERFP50548 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERFP50548 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERFP50548 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERFP50548 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERFP50548 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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