Protein–RNA interactions for Protein: P49763

PGF, Placenta growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGFP49763 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGFP49763 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGFP49763 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGFP49763 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGFP49763 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGFP49763 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGFP49763 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGFP49763 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGFP49763 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGFP49763 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGFP49763 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGFP49763 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGFP49763 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGFP49763 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGFP49763 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGFP49763 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGFP49763 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGFP49763 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGFP49763 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGFP49763 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGFP49763 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGFP49763 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGFP49763 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGFP49763 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGFP49763 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PGFP49763 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PGFP49763 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PGFP49763 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGFP49763 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGFP49763 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGFP49763 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGFP49763 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGFP49763 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGFP49763 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGFP49763 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGFP49763 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGFP49763 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PGFP49763 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGFP49763 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGFP49763 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGFP49763 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGFP49763 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGFP49763 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGFP49763 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGFP49763 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PGFP49763 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGFP49763 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGFP49763 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGFP49763 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGFP49763 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PGFP49763 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGFP49763 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGFP49763 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGFP49763 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGFP49763 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGFP49763 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGFP49763 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGFP49763 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGFP49763 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGFP49763 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGFP49763 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGFP49763 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGFP49763 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGFP49763 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGFP49763 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGFP49763 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGFP49763 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGFP49763 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGFP49763 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGFP49763 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGFP49763 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGFP49763 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGFP49763 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGFP49763 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGFP49763 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGFP49763 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGFP49763 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGFP49763 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PGFP49763 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGFP49763 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGFP49763 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PGFP49763 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGFP49763 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGFP49763 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGFP49763 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGFP49763 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGFP49763 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGFP49763 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGFP49763 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGFP49763 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGFP49763 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGFP49763 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGFP49763 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGFP49763 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGFP49763 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGFP49763 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGFP49763 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGFP49763 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGFP49763 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGFP49763 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms