Protein–RNA interactions for Protein: P49589

CARS, Cysteine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARSP49589 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CARSP49589 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CARSP49589 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CARSP49589 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CARSP49589 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CARSP49589 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CARSP49589 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CARSP49589 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CARSP49589 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CARSP49589 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CARSP49589 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CARSP49589 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CARSP49589 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CARSP49589 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CARSP49589 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CARSP49589 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CARSP49589 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CARSP49589 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CARSP49589 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CARSP49589 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CARSP49589 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CARSP49589 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CARSP49589 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CARSP49589 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CARSP49589 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CARSP49589 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARSP49589 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARSP49589 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARSP49589 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARSP49589 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARSP49589 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CARSP49589 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CARSP49589 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARSP49589 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARSP49589 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARSP49589 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARSP49589 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARSP49589 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARSP49589 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARSP49589 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARSP49589 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CARSP49589 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARSP49589 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARSP49589 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARSP49589 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARSP49589 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARSP49589 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARSP49589 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARSP49589 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARSP49589 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARSP49589 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARSP49589 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARSP49589 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARSP49589 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARSP49589 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARSP49589 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARSP49589 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARSP49589 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARSP49589 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARSP49589 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARSP49589 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARSP49589 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARSP49589 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CARSP49589 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARSP49589 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARSP49589 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARSP49589 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARSP49589 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARSP49589 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARSP49589 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARSP49589 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARSP49589 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARSP49589 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARSP49589 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARSP49589 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CARSP49589 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARSP49589 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARSP49589 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARSP49589 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARSP49589 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARSP49589 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARSP49589 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARSP49589 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARSP49589 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CARSP49589 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARSP49589 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARSP49589 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARSP49589 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARSP49589 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARSP49589 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CARSP49589 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARSP49589 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARSP49589 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARSP49589 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARSP49589 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARSP49589 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARSP49589 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARSP49589 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CARSP49589 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARSP49589 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms