Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPIAP49247 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPIAP49247 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPIAP49247 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPIAP49247 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPIAP49247 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPIAP49247 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPIAP49247 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPIAP49247 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPIAP49247 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPIAP49247 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPIAP49247 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPIAP49247 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPIAP49247 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPIAP49247 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPIAP49247 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPIAP49247 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPIAP49247 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPIAP49247 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPIAP49247 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPIAP49247 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPIAP49247 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPIAP49247 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPIAP49247 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPIAP49247 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPIAP49247 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPIAP49247 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPIAP49247 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPIAP49247 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPIAP49247 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPIAP49247 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPIAP49247 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPIAP49247 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPIAP49247 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPIAP49247 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPIAP49247 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPIAP49247 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPIAP49247 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPIAP49247 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPIAP49247 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPIAP49247 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPIAP49247 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPIAP49247 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPIAP49247 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPIAP49247 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPIAP49247 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPIAP49247 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPIAP49247 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPIAP49247 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPIAP49247 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPIAP49247 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPIAP49247 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPIAP49247 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPIAP49247 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPIAP49247 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPIAP49247 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPIAP49247 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPIAP49247 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPIAP49247 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPIAP49247 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RPIAP49247 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPIAP49247 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPIAP49247 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPIAP49247 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPIAP49247 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPIAP49247 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPIAP49247 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPIAP49247 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPIAP49247 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPIAP49247 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPIAP49247 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPIAP49247 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPIAP49247 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPIAP49247 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPIAP49247 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPIAP49247 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPIAP49247 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPIAP49247 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPIAP49247 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPIAP49247 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPIAP49247 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPIAP49247 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPIAP49247 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPIAP49247 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPIAP49247 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPIAP49247 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPIAP49247 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPIAP49247 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPIAP49247 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPIAP49247 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPIAP49247 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPIAP49247 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPIAP49247 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPIAP49247 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RPIAP49247 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPIAP49247 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPIAP49247 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPIAP49247 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPIAP49247 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPIAP49247 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms