Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGM4P49221 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGM4P49221 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGM4P49221 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGM4P49221 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM4P49221 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM4P49221 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM4P49221 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM4P49221 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM4P49221 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM4P49221 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGM4P49221 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGM4P49221 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGM4P49221 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGM4P49221 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGM4P49221 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TGM4P49221 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGM4P49221 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGM4P49221 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGM4P49221 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGM4P49221 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGM4P49221 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGM4P49221 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGM4P49221 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGM4P49221 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGM4P49221 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGM4P49221 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGM4P49221 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGM4P49221 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGM4P49221 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM4P49221 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM4P49221 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM4P49221 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM4P49221 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM4P49221 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM4P49221 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM4P49221 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM4P49221 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM4P49221 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TGM4P49221 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM4P49221 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM4P49221 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM4P49221 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM4P49221 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM4P49221 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM4P49221 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM4P49221 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM4P49221 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM4P49221 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM4P49221 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TGM4P49221 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TGM4P49221 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TGM4P49221 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TGM4P49221 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TGM4P49221 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TGM4P49221 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TGM4P49221 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TGM4P49221 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM4P49221 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM4P49221 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM4P49221 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM4P49221 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM4P49221 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM4P49221 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM4P49221 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM4P49221 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM4P49221 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM4P49221 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM4P49221 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM4P49221 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM4P49221 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM4P49221 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM4P49221 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TGM4P49221 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGM4P49221 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TGM4P49221 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGM4P49221 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TGM4P49221 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGM4P49221 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGM4P49221 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGM4P49221 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGM4P49221 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGM4P49221 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TGM4P49221 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGM4P49221 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGM4P49221 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGM4P49221 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGM4P49221 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGM4P49221 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGM4P49221 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGM4P49221 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGM4P49221 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGM4P49221 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGM4P49221 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGM4P49221 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TGM4P49221 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM4P49221 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM4P49221 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM4P49221 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TGM4P49221 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms