Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NMUP48645 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NMUP48645 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NMUP48645 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NMUP48645 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NMUP48645 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NMUP48645 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NMUP48645 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NMUP48645 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NMUP48645 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMUP48645 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMUP48645 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMUP48645 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMUP48645 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMUP48645 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMUP48645 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMUP48645 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMUP48645 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMUP48645 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMUP48645 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMUP48645 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMUP48645 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMUP48645 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMUP48645 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMUP48645 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMUP48645 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMUP48645 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMUP48645 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMUP48645 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMUP48645 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMUP48645 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMUP48645 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMUP48645 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMUP48645 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMUP48645 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMUP48645 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMUP48645 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMUP48645 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMUP48645 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMUP48645 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMUP48645 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMUP48645 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMUP48645 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMUP48645 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMUP48645 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMUP48645 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMUP48645 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMUP48645 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NMUP48645 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMUP48645 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMUP48645 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMUP48645 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMUP48645 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMUP48645 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMUP48645 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMUP48645 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMUP48645 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMUP48645 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMUP48645 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMUP48645 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NMUP48645 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NMUP48645 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NMUP48645 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NMUP48645 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMUP48645 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMUP48645 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMUP48645 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMUP48645 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMUP48645 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMUP48645 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMUP48645 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMUP48645 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMUP48645 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMUP48645 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMUP48645 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMUP48645 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMUP48645 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMUP48645 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NMUP48645 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMUP48645 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMUP48645 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMUP48645 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMUP48645 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMUP48645 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMUP48645 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMUP48645 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMUP48645 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMUP48645 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMUP48645 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMUP48645 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMUP48645 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMUP48645 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMUP48645 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMUP48645 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMUP48645 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMUP48645 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMUP48645 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMUP48645 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMUP48645 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMUP48645 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms