Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT5P48643 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT5P48643 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT5P48643 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT5P48643 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT5P48643 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT5P48643 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT5P48643 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT5P48643 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT5P48643 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCT5P48643 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCT5P48643 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCT5P48643 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCT5P48643 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCT5P48643 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCT5P48643 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCT5P48643 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCT5P48643 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCT5P48643 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCT5P48643 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCT5P48643 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCT5P48643 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCT5P48643 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCT5P48643 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCT5P48643 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCT5P48643 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCT5P48643 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCT5P48643 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCT5P48643 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCT5P48643 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCT5P48643 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCT5P48643 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCT5P48643 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCT5P48643 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCT5P48643 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCT5P48643 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT5P48643 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT5P48643 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT5P48643 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT5P48643 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT5P48643 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT5P48643 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT5P48643 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT5P48643 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT5P48643 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT5P48643 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT5P48643 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT5P48643 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT5P48643 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT5P48643 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT5P48643 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT5P48643 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT5P48643 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT5P48643 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT5P48643 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT5P48643 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT5P48643 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT5P48643 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT5P48643 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT5P48643 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT5P48643 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT5P48643 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT5P48643 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT5P48643 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT5P48643 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT5P48643 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT5P48643 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT5P48643 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT5P48643 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT5P48643 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT5P48643 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT5P48643 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT5P48643 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT5P48643 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT5P48643 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT5P48643 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT5P48643 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT5P48643 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT5P48643 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT5P48643 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT5P48643 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCT5P48643 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCT5P48643 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCT5P48643 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCT5P48643 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCT5P48643 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCT5P48643 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCT5P48643 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCT5P48643 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT5P48643 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT5P48643 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT5P48643 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT5P48643 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT5P48643 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT5P48643 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCT5P48643 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCT5P48643 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCT5P48643 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCT5P48643 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCT5P48643 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms